SIR harför närvarande tre arbetsgrupper, IT, IVA-STRAMA och FoU. Arbetsgruppen FoU är informell och representanter från medlemsavdelningar kan anmäla sig till att vilja delta till sammankallande. Medlemskapet i arbetsgruppen förutsätter ett aktivt åtagande till just utveckling och vilja att skapa vetenskaplig kvalitet inom registret.
Arbetsgruppen har i allmänhet möten i samband med och oftast tillsammans med de övriga arbetsgrupperna. FoU-gruppen har en särskild ställning i det etiska reglementet för att till styrelsen rekommendera hur man skall besvara förfrågningar om djupare studier i registret. Arbetsgruppen leds från september 2010 av professor Folke Sjöberg, Linköping.